À la fin de City Hunter, Ryo et Kaori commencent une nouvelle vie en tant que couple heureux.
La veille de leur mariage, une tueuse à gages redoutable nommée "Glass Heart" décide de se suicider.
Rongée par le remords d’avoir tué de nombreuses personnes, elle tente de se donner la mort.
Cependant, elle ne meurt pas et sombre dans un coma profond.
Pour assurer sa survie, elle nécessite une transplantation cardiaque d’urgence.